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fastq测序数据过滤和质控

你的测序数据质量靠谱吗?

— 张旭东

1. 基础知识

1.1 数据上传和完整性校验

#传输前,生成md5文件
md5sum *.fq.gz >md5.txt

#传输后,校验数据完整性
md5sum -c md5.txt


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